提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
“神兽”巡街,古画“活起来”……这场“云联欢”可太有看头了!******
正月十五到,
今宵灯火明。
元宵晚会看什么?
瞧
上海豫园花灯满,神兽巡街庆团圆
奇幻花灯秀《瑞兽闹山海》
依靠AR技术,
描绘《山海经》中
神兽闹新春的喜庆场景。
屋檐上的麒麟吊着灯笼,
为游荡在院内回廊的青龙引路;
专好音律的囚牛蹲在屋脊上,
欣赏弹拨弦拉的音乐;
“春神使者”玄鸟在豫园上空盘旋,
向攒尖顶上的祥兽“问好”,
致意祥和安宁!
观
洛阳城内灯如昼,鱼灯傩面街上行
簪花儿郎头戴面具跳起傩面舞,
驱赶疾病晦气。
珍珠面的女子们手擎鱼灯起舞,
企盼年年有余。
舞蹈《元夕之约》
与观众相约洛阳古城,
回到宋朝上元灯会闹花灯!
听
春夜笙歌迎佳节,花腔民乐交错鸣
B站up主“自得琴社”,
与女高音歌唱家吴碧霞、
歌手鞠红川
联袂创意演绎,
大唐古乐电音版《达拉崩吧》。
以让中国古画“活起来”的方式,
讲述中国传统五声音调名称,
民族乐器、古代八音、汉族传统记谱法等。
画面和人物体现中式秀美,
风格活泼可爱!
赏
月下起舞弄双影,苏子与妻情意绵
青年舞蹈家胡阳、华宵一用双人舞,
再现苏轼和妻子王闰之的爱情,
舞步婀娜多姿、刚柔并济。
还有还有!
虚拟人物洛天依演绎《诗经》名篇,
相声演员孟鹤堂、周九良
演绎的民间小曲《打新春》,
用诗意的方式
向全球华侨华人送上祝福!
四海团愿景,春来万象新。
国潮正当时,
上元之夜花样玩不停!
北京时间2月5日15:00,
敬请期待
“四海同春”
2023年全球华侨华人新春云联欢!
(中国侨网微信公众号)
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